Según DGI, cuando vence un CAE hay que anular todos los números no utilizados de ese cae:

El plazo de validez de la autorización del rango de números a utilizar en la documentación electrónica es de dos años, al vencimiento del plazo los números no utilizados deberán ser anulados e informados en el reporte diario correspondiente.

Fuente: https://www.efactura.dgi.gub.uy/principal/Preguntas_Frecuentes?es

Ingresando en Panel de Control > CAE verás en rojo los CAE que se encuentran vencidos, que son para los cuales se deberá anular la numeración no utilizada. Podrás acceder a la información de cada tipo de CAE pulsando sobre la carpeta ubicada a la izquierda de cada línea.

Dentro de cada CAE se podrá visualizar el próximo número a utilizar, que será el nro. de CFE a partir del cual se deberá realizar la anulación. A su vez, el nro. final del rango será el nro. final a anular.

Para anular el rango de CFE comprendido entre el Próximo nro a utilizar y el Nº Final se deberán seguir los pasos indicados en:

• ¿Cómo anulo un rango de CAE?

Una vez hayas realizado la anulación de los CFE vencidos que no fueron utilizados deberás solicitar nuevos CAE a DGI y cargarlos en el sistema para continuar facturando. Puedes ver los pasos a continuación:

• ¿Cómo pido CAE para facturar?

• ¿Cómo cargo los CAE en el sistema de facturación electrónica?